内六角螺栓占得空间要小得多，安装时内六角可以装在较深的位置，外六角安装（包括紧固）需要空间大。
一般的内六角比一般的外六角螺栓硬度高。
内六角适用于经常拆卸的地方（头部比外六角硬度高），或空间受限制的地方。
在使用上，内六角螺钉大多用于拧入到零件内部的内螺纹，螺栓大多是做外部链接用，大多是与外六角螺母联接。内六角螺钉美观，螺帽没有方向性，不像外六角螺栓，比如在台面上有多个螺栓头暴露，如果不将他的头部方向统一，就会感觉杂乱，而内六角就给人感觉很整齐。另外，在使用上，内六角螺钉大多用于比较精密，受力不会太大的地方，如电子机械设备等。大型受力较大的设备，如重型机械、冶金设备、大型压力机械使用内六角螺钉的就比较少。当然，使用上不是绝对的，我也见过煤炭挖掘机和大型工程机械上也有一些应用，只是比较少一些罢了。
